Dalam banyak kesan, Gus Dur mungkin bisa digambarkan dengan kata-kata yang singkat saja: Kompleks dan nyleneh. Oleh karena itu, pribadi Gus Dur cenderung sulit untuk di pahami, terutama dalam satu sudut tafsir atas dua kata itu, tergantung siapa yang melihat dan memahami. Bahkan pada saat ia menjabat sebagai Presiden RI, sempat muncul anekdot tentang tiga misteri Tuhan: yakni jodoh, kematian dan Gus Dur.