Tujuan filsafat ilmu adalah pertama, memperdalam unsur-unsur pokok ilmu sehingga secara menyeluruh dapat dipahami sumber, hakikat, dan tujuan dari ilmu. Kedua, memahami sejarah perkembangan serta kemajuan ilmu di berbagai bidang sehingga diperoleh gambaran mengenai proses penemuan ilmu sejak zaman Yunani Kuno hingga postmodernisme. Ketiga, mempertegas sikap bahwa antara ilmu dan agama sesungguhnya tidak ada pertentangan.